Le port de Ciutadella, situé sur l'île de Minorque, est l'un des ports historiques des îles Baléares. Son activité remonte au Moyen Âge, époque où Ciutadella était la capitale de l'île sous la couronne d'Aragon, mais son infrastructure portuaire n'a pris une ampleur significative qu'au milieu du XIXe siècle, avec l'achèvement ou l'amélioration des structures existantes.

En 1929, des travaux d'élargissement du port ont été entrepris, son étroitesse limitant la taille et la longueur des navires. Ces travaux se sont achevés 30 ans plus tard, en 1962. À cette date, grâce à cet élargissement et à d'autres aménagements importants tels que les voies d'accès et la cale de halage, le port a acquis sa configuration actuelle, même si de nombreuses améliorations y ont été apportées depuis.

Le port, initialement destiné au trafic commercial et de pêche, a connu au cours des dernières décennies une forte augmentation du nombre de bateaux de plaisance qui occupent toutes les berges propices à l'amarrage.

La section gérée directement compte 147 mouillages, auxquels il faut ajouter les 55 mouillages gérés par la CN de Ciutadella.